В 2005 г. за счёт слияния Государственного комитета обороны и Маджлисуль Шуры произошло новое преобразование, и возникает «Государственный комитет обороны – Маджлисуль Шура Чеченской республики Ичкерия». Это - орган координации вооружённой борьбы на территории Чеченской республики, северокавказского региона и в других субъектах России.
Одновременно с учреждением ГКО - МШ ЧРИ в его составе был сформирован Кавказский фронт ВС ЧРИ. Эти изменения были связаны с новопровозглашённым «президентом» ЧРИ Садулаевым.
Следующий после Садулаева подпольный «президент» ЧРИ Доку Умаров 6 июля 2006 года издал указ о формировании Уральского и Поволжского фронтов. Командующим Уральским фронтом был назначен Амир Ассадулла (Михаил Захаров), а командующим Поволжским фронтом — Амир Джундулла (Абдуррахман Камалутдинов).
В настоящее время (2007) в руководство шурой входят президент ЧРИ и военный амир ГКО - МШ ЧРИ Докка Умаров, вице-президент ЧРИ Супьян Абдуллаев, председатель Верховного Шариатского Суда ЧРИ А. Явмирзи (амир Мансур), начальник генерального штаба ВС ЧРИ Сейф- Ислам.