Национальный совет сопротивления Восточного Тимора основан на прошедшей в 1998 г. в Португалии Первой национальной конвенции Восточного Тимора. КНРТ заменил ранее существовавшую организацию Национальный совет сопротивления Маубере.
КНРТ являлся «зонтичной» организацией. Соучредителями КНРТ являются: Тиморский демократический союз, Тиморская демократическая народная ассоциация и КОТА (Kalibun Oan Timor Aswaen). Политической целью КНРТ была борьба за независимость Восточного Тимора от индонезийской оккупации.