Активизация радикального коммунистического движения в Японии связано с разоблачениями сталинских преступлении и последовавшей в след за тем ревизии коммунистической политики в СССР. Японская Коммунистическая Лига была создана в результате раскола Коммунистической партии Японии, который произошёл в 1957 году.
В 1958 году начинается деятельность вооружённой студенческой организации Зенгакурен (Zen-gaku-ren, All-Japan Federation of Student Association). Значительным фактором активизации леворадикального движения в Японии было военное сотрудничество Японии и США, а также война во Вьетнаме, которая вызвала протест левых по всему миру. Зенгакурен организовывала студенческие беспорядки в Токио в 1968 году.
Сёкигун была основана в результате внутренний политической борьбы 8 августа 1969 года. Первоначально организация носила название Сёкигун-ха (Красная Армия), позже принимает название Фракция Красной Армии.
В качестве противников революции рассматривали мировой империализм, сионизм, советский ревизионизм. Этапами к мировой революции должно быть создание Красных Армий Африки, Латинской Америки, Японии и Кореи, объединение их в Мировую Красную Армию, затем создание Мировой революционной партии и Мирового революционного фронта.
Целью организации провозглашалось: развязать революцию и гражданскую войну в Японии, в которой будет создан чистый социализм, и спровоцировать мировую революционную войну: Во главе организации находился Такая Сиоми (Takaya Shiomi), который говорил: «Революции возникают не из революционной борьбы масс, но являются результатом вооружённого насилия».
В марте 1970 года группа террористов Нихон Сёкигун во главе с Такамаро Тамийя (Takamaro Tamiya) совершает угон авиалайнера компании "Yodo-Go" в Северную Корею. Этот авиаугон, по замыслу террористов, должен был спровоцировать вооружённое восстание в Японии и всемирную революцию. В 1971 году Нихон Сёкигун и Кэйхин Ампо Кёто совместно формируют Объединённую Красную Армию.